赣州市中医院设置有急诊科、内科、儿科、外科、骨伤科、肛肠科、妇产科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、康复科、医学影像科、检验科、功能检查科等十多个临床、辅助科室和专病诊室。现有中高级职称医务人员77人,床位225张。医院医疗设备齐全,有进口CT、 CR影像诊断设备、500mAX线机、电视手术X线机、50mA移动X线机、电子胃肠镜、全自动生化分析仪、进口彩色B超机和关节镜等大型先进设备。赣州市中医院始终坚持突出中医特色的办院方向,走中西医结合道路。现有一大批省、市级名中医和著名老中医,另有多人被列为江西省名中医培养人才。年门诊量12万人次,年住院病人4千多人次,年手术近2000台次。医院骨伤科为国家级重点建设专科,先后开展了骨肿瘤、颈椎前后路、胸腰椎骨折前后路、人工全髋关节置换等骨科手术,以及关节镜下微创手术治疗膝、肩、踝关节疾病等。肛肠科、康复科是省、市两级重点建设中医特色专科,技术力量雄厚、中医特色突出。肛肠科运用中西医结合方法治疗各种痔疮、肛周脓肿、肛瘘、直肠息肉、直肠脱垂(脱肛)等,疗效显著。康复科运用针刺、艾灸、理疗、薰洗、敷贴等疗法,治疗中风后遗症、面瘫、三叉神经痛、腰腿痛、颈性弦晕、带状疱疹等疾病颇具特色。内科运用中医中药治疗肺系疾病:哮喘、心系疾病:冠心病、高血压病、消化系疾病:溃疡病、肝病、肾系疾病:肾衰、糖尿病、风湿病等疾病效果明显。